Rudolf-Schönheimer Institut für Biochemie
Physische Proteintrennung als Signalgeber
Hintergrund und Ziel der Arbeit: Eine Vielzahl von membranständigen Sensormolekülen triggern zelluläre Signalpfade durch Konformationsänderungen ihrer Struktur auf einen Stimulus hin. Adhäsions-G-Protein-gekoppelte Rezeptoren (aGPCRs) verfügen möglicherweise über weitere alternative Wege zur Aktivierung, z.B. die physische Trennung des Rezeptors in mehrere Fragmente. Die Erforschung dieser anderen Signalmechanismen steckt momentan noch in den Kinderschuhen, ist aber essenziell für das Verständnis der Wirkung von aGPCRs im Rahmen der Entwicklung und Funktion von etlichen Organen, z.B. des Gehirns, und ihrer Beteiligung an onkologischen Prozessen wie der Entstehung und Ausbreitung von vielen Krebsarten.
Um unsere Annahme über Proteintrennung von aGPCRs als Signalinduktor zu überprüfen, haben wir gen-manipulierte Taufliegen entwickelt, die mit molekularen Sensoren ausgestattet worden sind. Diese sollen im gut experimentell zugänglichen Organismus, Drosophila melanogaster (Taufliege) funktionell untersucht werden.
Metoden: Molekularbiologie; Genetische Kreuzungsexperimente; Statische und in vivo Bildgebung; Genetische Screens
Aufgabenstellung: Die Doktorandin/Der Doktorand wird basierend auf bereits existierenden molekularen Sensoren deren Expression im Nervensystem der Taufliege untersuchen. Den Ergebnissen dieser Untersuchung wird sich die Charakterisierung von bereits vorhandenen mutanten Fliegenstämmen mit verschiedenen Methoden (anatomische Studien, Verhaltenstests, biochemische Analysen, funktionelle Bildgebung, genetische Screens) anschliessen, um Fehlfunktionen von nicht-spaltbaren aGPCR-Proteinen zu entdecken und besser zu verstehen.
Zeitraum: Ab dem nächstmöglichen Starttermin; mindestens 1 Freisemester Grundvoraussetzung für die Bearbeitung des Themas
Interessenten melden sich bitte bei:
Professor Dr. med. Tobias Langenhan, D.Phil. (Oxon)
Lehrstuhl für Allgemeine Biochemie
Rudolf-Schoenheimer Institut für Biochemie
Johannisallee 30, 04103 Leipzig
Tel.: 0341 97-22100
E-Mail:
tobias.langenhan@medizin.uni-leipzig.de
(veröffentlicht: 08.01.2020)
Paul-Flechsig-Institut für Hirnforschung
Wir bieten:
- experimentelle Promotionsarbeit zum Thema „Enzymatische Regulation von CCL2 bei Neuroinflammation“
- zeitnaher Beginn der Promotion an unserem Institut im Zentralen Forschungsgebäude
- umfangreiche Betreuung beim Anlernen der praktischen Arbeiten und bei der Auswertung der Daten
- Publikation der erhobenen Daten
Inhalt: Die Doktorarbeit befasst sich mit der enzymatischen Regulation der biologischen Aktivität des Chemokins CCL2 unter entzündlichen Bedingungen im Gehirn in einem Mausmodell der Ischämie. Ziel ist es aufzuklären, wie die Regulation und Interaktion von spezifischen Enzymen bei der Modifikation von CCL2 ineinandergreifen und welche Folgen sie auf das Infarktgeschehen und den neurologischen Status haben können. Die Charakterisierung der Regulationsmechanismen von CCL2 bei Ischämie im Gehirn soll grundlegende Einblicke Mechanismen der Entzündungsreaktion identifizieren und so neue therapeutische Angriffspunkte, die nicht nur bei ischämischen, sondern allgemein auch bei anderen akuten und chronischen Entzündungsprozessen eine Rolle spielen können.
Metoden: Praktische Arbeiten umfassen immunhistochemische Färbung von Hirngewebe mittels Fluoreszenzfarbstoffen, Datenerhebung am Mikroskop (Slidescanner, Laserscanning, Lightsheet) und umfangreiche Auswertung.
Interessenten melden sich bitte bei:
Prof. Dr. Steffen Roßner
Paul-Flechsig-Institut für Hirnforschung
Liebigstraße 19, 04103 Leipzig
E-Mail:
Steffen.Rossner@medizin.uni-leipzig.de
(veröffentlicht: 07.11.2019)
Klinik für Kinderchirurgie
Wir bieten:
- experimentelle Promotionsarbeit im Fachbereich Kinderchirurgie zum Thema angeborene Zwerchfellhernie (CDH)
- intensive Betreuung, sehr interessantes und spannendes Forschungsthema (eigenes Forschungslabor mit Laborleiterin)
- bei überdurchschnittlichem Engagement: möglicher Forschungsaufenthalt im Rahmen der Promotion in Winnipeg (Kanada) mit Top Betreuung bei international führendem CDH Forscher (Prof. Richard Keijzer)
Wir erwarten:
- abgeschlossenes Physikum mit guter – sehr guter Leistung
- 120% Engagement, intrinsische Motivation
- Bereitschaft für Auslandsaufenthalt in Kanada
- Publikationspromotion nach Abschluss
Zeitraum: 1 Jahr Forschungsarbeit (2 Semester für Promotion), Deadline:
31.08.2019
Interessenten melden sich - unter Einsendung von Motivationsschreiben, Lebenslauf, Zeugnissen etc. - bitte bei:
Prof. Dr. Martin Lacher
Ärztlicher Direktor
Klinik und Poliklinik für Kinderchirurgie, Universitätsklinikum Leipzig
Liebigstraße 20a, 04103 Leipzig
Tel.: 0341-97 26400
E-Mail:
martin.lacher@medizin.uni-leipzig.de und
richard.wagner@medizin.uni-leipzig.de
(eingestellt: 09.07.2019)
Medical Clinic I – Hematology and Cell Therapy, Leipzig University, Germany
PhD student position (biologischer Doktorand, cand. Dr. rer. nat.)
about RNA biology in acute myeloid leukemia
Title:
microRNAs in acute myeloid leukemia
Description: A PhD student position (biologischer Doktorand, cand. Dr. rer. nat.) is available in the research group Behre from the Medical Clinic 1 - Hematology at Leipzig University for applicants interested in gene regulation and epigenetics in acute myeloid leukemia (AML) and stem cell biology. The main focus of the laboratory is the role of RNA in gene / epigenetic regulation, particularly in hematopoiesis and leukemias. Examples are regulation of microRNAs by key transcription factors such as C/EBPalpha in myeloid differentiation and acute myeloid leukemia (Wurm et al., Nature Comm. 2017: Disruption of the C/EBPalpha - miR-182 balance impairs granulocytic differentiation), translational usage of microRNAs to overcome treatment resistance in AML (Krakowsky et al., Blood Cancer J 2018: miR-451a abrogates treatment resistance in FLT3-ITD-positive acute myeloid leukemia), or microRNAs targeting transcription factors in the pathogenesis of AML (Gerloff et al., Leukemia 2014: NF-kappa B/STAT5/miR-155 network targets PU.1 in FLT3-ITD-driven acute myeloid leukemia). Please also have a look at our further recent publications: Katzerke, Blood 2013; Hartmann, Cell Death Dis 2018; Namasu, Oncotarget 2017; Pulikkan, Leukemia 2017; Braeuer-Hartmann, Cancer Research 2015; Pulikkan JA, Peramangalam PS, Blood 2010; Pulikkan, Dengler, Blood 2010; Pulikkan, Leukemia 2010.
The focus of our work is on basic molecular and cellular investigations of leukemia biology, especially in the biology of small and long non-coding (lnc) RNAs and their role in initiation and maintenance of AML, and the translation of this knowledge into novel therapeutic concepts for AML. These projects include basic in vitro investigations as well as verification in appropriate mouse models. In the planned projects, we intend to study the suitability of specific microRNAs and lncRNAs as therapeutic targets in AML, or as translational tools to overcome therapy resistance in AML. Furthermore, we aim to use RNA expression profiles to guide AML treatment decisions. Methods used in the lab include microRNA, lncRNA, and whole transcriptome profiling with next generation sequencing (NGS) with subsequent bioinformatics and mechanistic and functional analysis of microRNAs, e.g. with CRISPR/Cas9 technology and in vivo AML xenograft mouse models or inducible C/EBPalpha knock-out mice. Other projects involving gene regulation and leukemia are ongoing as well.
PhD student candidates must have a proven track record in research and laboratory work. Ability to communicate in written and spoken English is required. Experiences in molecular biology and biochemistry including molecular cloning, next generation sequencing (NGS), bioinformatics, and animal handling is necessary.
For your application, please include:
- full curriculum vitae
- publication list
- information on years of experience in research and laboratory work including the methods you already know how to do perfectly
- names and contact information (email and telephone numbers) of 3 references
- a summary of research interests and long term plans
- two half page proposals of which two projects the applicant might want to do in the laboratory during 3 years. Only shortlisted applicants will be notified
If you are interested please contact:
Prof. Dr. med. Gerhard Behre
E-Mail:
gerhard.behre@medizin.uni-leipzig.de
(date: 12.09.2019)
