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Nicht-virale, Polymer-basierte Systeme zur Induktion von CRISPR/Cas und Base Editing

​​​​​​​​Die CRISPR/Cas Technologie ist ein effizientes Gene-Editing System und in der biomedizinischen Forschung bereits weit verbreitet. Viele auf CRISPR/Cas basierende Therapieansätze sind in der Entwicklung gegen verschiedene Erkrankungen, und diese können auch in der personalisierten Krebstherapie als besonders vielversprechend gelten. Eine Weiterentwicklung von CRISPR/Cas stellt das Base Editing dar, das den Austausch definierter Nukleotide im Genom gestattet. Konkret beinhaltet dies die Konversion von Cytosin in Thymin (C in ​T; cytosine base editing CBE)), die in einer C•G zu T•A Substitution resultiert, oder die Konversion von Adenosin in Guanin (A in G; adenosine base editing (ABE), die zu einer A•T zu G•C Substitution führt.

CRISPR/Cas-basierte Technologien sind jedoch auch mit Herausforderungen verbunden, einschließlich der effizienten Einschleusung der CRISPR Komponenten in die Zielzellen bzw. Zielorgane. Dies erfordert die Entwicklung Nano-basierter Einschleusungssysteme zur Formulierung von Cas und der single guide RNA (sgRNA).

Dieses Projekt beschäftigt sich mit der Entwicklung polymerer Nanocarrier zur Einschleusung von Cas als mRNA oder minicircle DNA (mcDNA) und der sgRNA. Während dies auf der Kombination zweier Nanocarrier beruhen kann, ist die Hauptzielsetzung, basierend auf den existierenden Polymer-Plattformtechnologie in der AG Aigner, die Herstellung von Polymeren zur gleichzeitigen Formulierung und Einschleusung beider CRISPR/Cas Komponenten in einem einzigen Nanocarrier. Diese werden in Reporterzelllinien in vitro untersucht und dann in relevante in vitro / ex vivo Tumormodelle überführt, mit anschließender Testung in vivo.

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Englisch Project Description

Non-viral, polymer-based systems for inducing CRISPR/Cas and Base Editing

The CRISPR technology is a powerful gene-editing system and already widely used in biomedical research. With therapeutic approaches based on CRISPR/Cas9 being under development for treating various diseases, it may also be considered as one of the most promising strategies in personalized cancer therapy. Developing CRISPR/Cas further, base editing has been introduced, that allows for exchanging defined nucleotides in the genome. More specifically, this includes the conversion from cytosine into thymine (C to T; cytosine base editing CBE)), resulting in a C•G to T•A substitution, or the conversion from adenosine into guanine (A to G; adenosine base editing (ABE), leading to an A•T to G•C substitution).

However, CRISPR/Cas-based technologies are also associated with issues, including the efficient delivery of the CRISPR components into target cells or target organs. This requires the development of nano-based delivery syst​ems, for formulating Cas9 along with the single guide RNA (sgRNA).

This project aims at the development of polymeric nanocarriers capable of delivering Cas9 as mRNA or minicircle DNA (mcDNA) and the sgRNA. While this may rely on the combination of two nanocarriers, our main goal, based on the existing polymer platform in the Aigner group, are polymers for the simultaneous delivery of both CRISPR/Cas components in a single nanocarrier. These are analyzed in reporter cell lines in vitro and then transferred to relevant in vitro / ex vivo tumor models, prior to testing in vivo.​

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